Природа и животный мир
Большая часть озера окружена камышами, которые служат средой обитания диких животных (что делает озеро важным местом отдыха перелетных птиц ) и собираются зимой, как только лед становится достаточно твердым. Это служит двойной цели: одной экологической (удаление основной части органических веществ, которые в противном случае разложились бы в озере) и одной экономической (тростник продается для различных целей, в основном связанных со строительством и жилищным строительством). В летние месяцы случаются периодические пожары тростника, так как сухой тростник легко воспламеняется, а из-за почти постоянного ветра пожары быстро распространяются. Качество воды определяется температурой, ветром, а также количеством соли и ила, выделяемых грунтовыми водами из отложений .
В первой половине 20 века обсуждались несколько планов строительства плотин и других интрузивных строительных работ, которые разрушили бы озеро и его биотопы, но ни к чему не привели. Подробные планы по разделению дна озера земляными работами, чтобы некоторые части с достаточно плодородной почвой могли быть осушены навсегда и востребованы для использования в сельском хозяйстве, в то время как остальные части будут использоваться для интенсивной аквакультуры, были завершены и утверждены в 1918 году, но были заброшены, когда большая часть озера стал австрийской территорией после Первой мировой войны. В 1971 году планы строительства моста через австрийскую часть озера были сорваны защитниками окружающей среды.
В 1993 году национальный парк Нойзидлер-Зее-Зеевинкель получил международное признание как заповедник категории II МСОП. В 2001 году национальные парки в Австрии и Фертё-Хансаг в Венгрии были вместе признаны объектом Всемирного наследия . Озеро Нойзидлерзее и его окрестности в Австрии также находятся под защитой Рамсарской конвенции о водно-болотных угодьях.
Флора и фауна
Поверхность озера сильно заросла тростником, через который местами прорублены проходы для лодок.
В озере обитает 15 видов рыб (наиболее распространенные — вьюны, судак, щука и сазан). Воды озера богаты разными видами беспозвоночных, а в зарослях камыша обитают различные виды редких насекомых.
На озере Нойзидлер-Зе в естественных условиях можно наблюдать более 300 видов гнездящихся и перелётных птиц, среди которых множество видов цапель (включая большую белую), а также колпицы, дикие гуси, поганки, свиязь, камышовки и многие другие.
Во время сезонных миграций здесь останавливаются бекасы, гуменники и зуйки. Среди редких видов птиц стоит отметить краснозобую казарку, орлана-белохвоста и луня.